Kimyasal yöntemlere alternatif olarak, zararsız mikroorganizmaların bu tür mikrokirleticileri içeren suların arıtılmasında kullanılması yönünde son yıllarda çok sayıda araştırma yapılmakta olup elde edilen sonuçlar, fungusların farklı çevresel koşullara kendilerini üstün bir şekilde adapte edebilme kabiliyetinde olduğunu, birçok toksik ve zor parçalanan bileşikleri içeren atık suların (tekstil, kozmetik, kağıt, deri gibi farklı boya ve pigment içeren tüm sanayi atıksuları) biyoarıtımında kullanılabileceğini göstermektedir.
Son yıllardaki çalışmalar, atık sulardaki antibiyotikleri ve çeşitli ilaç kalıntılarını biyolojik olarak kullanabilen farklı fungus türlerine odaklanmıştır.